畜禽粪便本身就是很好的有机肥料,非常适合土壤改造,促进农作物增收,但是许多粪便、尿液普遍含里有抗生素、重金属等，这些都可造成水、土污染。畜禽使用的抗生素约有30%-90%以原形通过排泄物排出，使粪便得综合利用产生很大影响，粪尿中大量的氮磷等可导致土壤盐渍化和水富营养化，畜禽产生氨气、硫化氢等影响空气质量。面临巨大环保压力，养殖业在积极找寻改解决措施实现洁净生产，减少有害物质排放。

首先使用中兽药替代抗生素，其有效和安全，不仅能从源头上减少抗生素的使用，而且能保健和预防治疗疾病，提高营养转化水平，降低死淘，符合当前环保需要。

中兽药药材是取自天然，有的是药食同源，对机体无代谢负担，不污染环境。目前采用的千余种中草药是前人从无数应用实践中筛选的，是被证明对畜禽有益无害的外源性物质。主要是一些活性成分和营养物质。活性成分，如多糖、低聚糖、生物碱、甙类、酶类、有机醇、鞣质及多酚类、色素和挥发油等，这些成分分别有各自的独特作用，更重要的是它们相互作用显示的综合功能，体内发挥治疗和保健作用的同时都可被吸收分解。其次是营养成分，如淀粉、蛋白质、氨基酸、纤维素、脂肪、维生素等。这些物质原本就是生物机体的组成和维持生态平衡所不可缺少的物质，到了体内有的被吸收利用，有的被分解排出体外，即使不被排出，也对人体没有毒害作用。

肉鸡生产养殖中，养殖户使用具有健脾、助消化功效的中药降低料肉比使，营养物质充分吸收，粪便含氮化合物明显降低，减轻对环境污染。有实验证明，在肉鸡育肥期30-34日龄使用健脾中兽药裨卫建，不仅每只鸡多收益0.1元，而且检测干粪中含氮化合物的量比空白组减少5%。网养肉鸡在全程添加健脾中兽药，空气的氨气味道轻,优化了环境减少净化成本,降低了污染物排放。

生猪养殖过程中，粪污、粪水带来的环保压力巨大。一个存栏6000头的猪场，附带产生猪粪12吨，尿液19吨，污水约70-150吨，一个规模化猪场每天所需要解决的粪尿污水量巨大。养猪场使用中药除臭剂添加到猪饲料中，如含有陈皮、厚朴、木香等，不仅可以提高猪对饲料的消化率，还能减少有机物的排放，降低排泄物的臭气，有效改善粪污污染力。还有些中药提取物作为饲料添加剂，可以促进猪体钙磷的吸收，尤其对妊娠母猪而言，减少了钙磷的损失，同时减少磷的排放，有效减轻环境污染问题。